نسخه اصلی نسخه دست نویس محققان ، که در ماه مارس به صورت آنلاین ارائه شد ، از اولین كتاب هایی بود كه میل یا تمایل زیاد اتصال SARS-CoV-2 به ACE2 انسان را محاسبه كرد. این گزارش در تاریخ 18 سپتامبر به صورت آنلاین منتشر شد مجله “بیوتکنولوژی محاسباتی و ساختاری”. ایده کار و هدایت آن کار Costas Maranas ، پروفسور دونالد بروتون در گروه مهندسی شیمی و دانشجوی سابق وی راتول چودوری بود که هم اکنون دانشجوی دکترا در دانشکده پزشکی هاروارد است.

ودا شیرش بورلا ، دانشجوی دکتری مهندسی شیمی و از نویسندگان مقاله ، گفت: “ما علاقه مند بودیم به دو سوال مهم پاسخ دهیم.” “ما ابتدا می خواستیم تغییرات اساسی ساختاری را که به COVID-19 میل بیشتری نسبت به SARS برای پروتئین های ACE2 انسان می دهد ، شناسایی کنیم و سپس میل بالقوه آن را برای حیوانات یا سایر پروتئین های حیوانی ACE2 ارزیابی کنیم.”

محققان مدل اتصال پیک پروتئین SARS-CoV-2 به ACE2 را که در دستگاه تنفسی فوقانی قرار دارد و به عنوان یک نقطه ورود برای سایر ویروس های کرونا ، از جمله SARS ، محاسبه می کنند ، محاسبه کردند. این تیم از یک روش مدل سازی مولکولی برای محاسبه قدرت اتصال و فعل و انفعالات اتصال پروتئین ویروسی به ACE2 استفاده کردند.

این تیم دریافت که اوج پروتئین SARS-CoV-2 برای اتصال به ACE2 انسان بسیار بهینه شده است. شبیه سازی های پیوست ویروسی به پروتئین های همولوگ ACE2 در خفاش ها ، گاوها ، مرغ ها ، اسب ها ، گربه ها و سگ ها بیشترین میل را برای خفاش ها و ACE2 انسانی نشان دادند ، با توجه به مقادیر پایین تر میل برای گربه ها ، اسب ها ، سگ ها ، گاوها و مرغ ها ، چودوری

چوودوری ، که در پاییز سال 2019 موفق به دریافت دکترای مهندسی شیمی در پنسیلوانیا شد ، گفت: “جدا از توضیح مکانیسم مولکولی اتصال به ACE2 ، ما همچنین تغییراتی را در اوج ویروسی بررسی کردیم که می تواند میل آن را برای ACE2 تغییر دهد.”

درک رفتار اتصال موج ویروس به ACE2 و تحمل ویروس در برابر این تغییرات ساختاری در قله ها ممکن است تحقیقات آینده را در مورد دوام واکسن و پتانسیل ویروس برای گسترش آن به سایر گونه ها آگاه کند.

چاودری گفت: “گردش کار محاسباتی که ایجاد کرده ایم باید بتواند با سایر مکانیسم های ورود واسطه اتصال گیرنده ها برای ویروس های دیگر که ممکن است در آینده ایجاد شوند ، مقابله کند.”

وزارت زراعت ، وزارت نیرو و بنیاد ملی علوم از این کار حمایت کردند.

منبع تاریخچه:

مواد تهیه شده توسط ایالت پن. اصلی ، نوشته شده توسط گابریل استوارت. توجه: مطالب را می توان از نظر سبک و طول ویرایش کرد.