اولین “سه رمزگذار” DNA در جهان در جیب شما – ScienceDaily


دانشمندان Cold Spring Harbour (CSHL) اولین آنالیز کننده توالی ژن تلفن همراه در جهان را توسعه داده اند ، یک برنامه جدید آیفون به نام iGenomics. با جفت سازی آیفون با یک ترتیب سنج دستی DNA ، کاربران می توانند یک آزمایشگاه ژنتیک موبایل ایجاد کنند که یادآور “tricorade” برجسته در Star Trek باشد. برنامه iGenomics کاملاً روی دستگاه iOS اجرا می شود و از این طریق نیاز به لپ تاپ یا تجهیزات بزرگ در محل که برای کارگران همه گیر و محیط زیست مفید است را کاهش می دهد. Aspin Palatnik برای مدت هشت سال و از آنجا که یک کارآموز 14 ساله دبیرستان بود ، در آزمایشگاه استادیار کمکی CSHL مایکل شاتز برنامه نویسی iGenomics را انجام داده است.

برنامه آیفون برای تکمیل دستگاه های کوچک توالی DNA تولید شده توسط Oxford Nanopore طراحی شده است. Palatnick ، ​​اکنون مهندس نرم افزار در فیس بوک ، قبلاً با عضویت در آزمایشگاه Schatz تجربه ایجاد برنامه های آیفون را داشت. او و شاتز دریافتند که:

“از آنجا که توالی سنج ها به رشد حتی کوچکتری ادامه می دهند ، هیچ فناوری در دسترس شما نبود تا بتوانید این DNA را روی دستگاه تلفن همراه مطالعه کنید. بیشتر مطالعات DNA: ترازبندی ، تجزیه و تحلیل بر روی خوشه های سرور بزرگ یا لپ تاپ های سطح بالا انجام می شود.”

شاتز اذعان کرد که دانشمندان بیماری های همه گیر “در چمدان های پر از نانو منفذ و لپ تاپ و سرورهای دیگر پرواز می کنند تا این تجزیه و تحلیل را در زمینه های دور انجام دهند.” iGenomics با ایجاد قابلیت حمل ، دسترسی و دسترسی بیشتر به تحقیقات ژنوم کمک می کند.

کاربران می توانند AirDrop داده های خود را توالی دهند ، اجازه می دهد تا تجزیه و تحلیل DNA را در دورترین مکان ها – حتی در مواردی که دسترسی به اینترنت ندارند – انجام دهید. شاتز توصیف می کند: iGenomics به زودی حتی ممکن است به دست فضانوردان بیفتد.

“علاقه زیادی به انجام توالی DNA در فضا وجود دارد. من سعی می کنم ببینم راهی برای قرار دادن iGenomics وجود دارد یا خیر. افراد زیادی علاقه مند به این کار هستند. این یک واقعیت واقعی است که انجام چنین کاری غیرممکن است.” شما می دانید ، هر گونه تجزیه و تحلیل از رایانه های معمولی وجود دارد.

در دفتر خاطرات گیگاناوکا، Palatnick و Schatz گزارش دادند که الگوریتم iGenomics می تواند به سرعت توالی DNA عوامل بیماری زای ویروسی مانند ویروس آنفلوانزا یا ویروس Zika را ترسیم کرده و جهش های مهم برای تشخیص و درمان را شناسایی کند. آنها همچنین یک درس آنلاین در مورد تجزیه و تحلیل سایر ژنوم های ویروسی ، به عنوان مثال از یک بیمار مبتلا به SARS-CoV-2 ، ارائه می دهند.

Shatz آرزو دارد که این دستگاه به کارگران و شهروندان کمک کند:

“امروز همه ما دوربین های حرفه ای را در جیب خود حمل می کنیم ، بنابراین تصور در چند سال آینده چندان سخت نیست که همه ما توالی های DNA خود را نیز در تلفن های هوشمند خود حمل کنیم. فرصت های زیادی برای اندازه گیری محیط و نگاه عوامل بیماری زا ، حتی ممکن است از خودتان اسکن کنید. “

منبع تاریخچه:

مواد تهیه شده توسط آزمایشگاه Cold Spring Harbour. اصلی ، نوشته شده توسط لوئیز ساندووال. توجه: مطالب را می توان از نظر سبک و طول ویرایش کرد.


منبع: hobobat-news.ir

دیدگاهتان را بنویسید

Comment
Name*
Mail*
Website*